Pour la première fois, un jeu Lego donne aux joueurs la possibilité d'incarner pendant tout le jeu un super-vilain, qui libère la puissance d'anciens artefacts facétieux et sème la panique dans une histoire pleine d'action et d'humour écrite en collaboration avec DC Comics.

Le jeu se déroule dans un monde ouvert en constante expansion du DC Universe, dans lequel la Ligue des Justiciers a disparu laissant la protection de la Terre à leurs confrères venus d'un univers parallèle, qui se sont autoproclamés « Syndicat du Crime ». Parfois, il faut bien plus qu'un super-héros pour accomplir le travail : c'est au tour du joueur, accompagné d'une bande de marginaux, de découvrir quelles sont les véritables intentions de ce nouveau groupe étrange de super-héros venus sauver la Terre.

Avec une équipe de super-vilains célèbres comme Le Joker, Harley Quinn, Lex Luthor, Deathstroke, Killer Frost, Sinestro et bien d'autres personnages issus de la Ligue d'Injustice, les joueurs vivront une aventure épique, pour s'assurer que ce sont bien eux les plus méchants.